明军的具体部署是：杨镐坐镇沈阳指挥；总兵马林率1万5千人，出开原，经三岔儿堡，入浑河上游地区，从北面进攻；总兵杜松率兵约3万人的主力部队担任主攻，由沈阳出抚顺关入苏子河谷，由西面进攻；总兵李如柏率兵2万5千人，由西南面进攻；总兵刘綎率兵1万余人，会合朝鲜军共2万余人，经宽甸沿董家江北上，由南面进攻。
另外，总兵祁秉忠，辽东将领张承基、柴国柱等部驻守辽阳，作为机动增援部队；总兵李光荣率兵一部驻广宁，保障后方交通。副总兵窦承武驻前屯监视蒙古各部；以管屯都司王绍勋总管运输粮草辎重。
杨镐本人则坐镇沈阳，居中指挥。
杨镐另外奏上“擒奴赏格”的奏疏。
兵部尚书黄嘉善复奏，朱翊钧批准，同时颁示天下。
这次赏格规定：擒斩努尔哈赤者赏银10000两，升都指挥使；擒斩其八大贝勒者赏银2000两，升指挥使；李永芳、佟养性等叛将，若能俘献努尔哈赤，可以免死。又诏令叶赫贝勒金台石、布扬古若能擒斩努尔哈赤，将给与建州敕书并封龙虎将军、散阶正二品。若擒斩其余努尔哈赤的十二亲属伯叔弟侄，及其中军、前锋、领兵大头目、亲信领兵中外用事小头目等，一律重赏并且封授世职。
原拟公元1619年农历二月二十一日出边进击，但因天降大雪，改为同月二十五日。同时，限令明军四路兵马于农历三月初二会攻赫图阿拉。
而后金方面的准备是：努尔哈赤在攻破抚顺、清河之后，鉴于同明军交战路途遥远，需要在与明辽东都司交界处设一前进基地，以备牧马歇兵，于是在吉林崖筑城屯兵，加强防御设施，派兵守卫，以扼制明军西来之路。
努尔哈赤探知明军行动后，认为明军南北二路道路险阻，路途遥远，不能即至，宜先败其中路之兵，于是决定采取“凭你几路来，我只一路去”的集中兵力、逐路击破的作战方针，将六万兵力集结于都城附近，准备迎战。
他这个做法非常的高明，因为明军分散，兵力虽强，但已不可怕！自己只要集中兵力，就能击败明军！
努尔哈赤，是个掌握形势的人！是个有着敏锐军事头脑的人！
公元1619年农历二月二十九日，后金军发现明朝刘綎军先头部队自宽甸北上，杜松率领明军主力已出抚顺关东进，但进展过速，孤立突出。
努尔哈赤接到奏报以后，决定以原在赫图阿拉南驻防的500兵马迟滞刘綎，乘其他几路明军进展迟缓之机，集中八旗兵力，迎击杜松军！
努尔哈赤说：“大明军队确实来攻打我们了，我们南方已有驻兵五百人，就用这些军队抵御南方的敌军吧。这是明军声东击西的战术，他们故意让南方的军队先让我们知道，这是要引诱我们的军队开向南方，他们的主力大军一定会从西边抚顺关的方向来进攻的。我们要先打他从西边来的军队。”
他立即命令诸王贝勒和大臣领城中兵出发向西迎敌。
军队正行进的时候，哨探又来向努尔哈赤报告说：“东南方向从清河城那条路上又有明军队兵来了。”
努尔哈赤当机立断说：“清河城方向这一路虽然有军队，但这条路地形狭隘险峻，他们不可能很快赶到，就让他们自己来吧，我们先到抚顺关迎击西面的敌军。”