马林军营中士兵放枪接战。
满州兵射箭冲击，在东面和南面两路夹攻之下，大明军队抵挡不住进攻势头，大败而逃，满州军兵乘势追杀，击破潘宗颜部，北路明军大部被歼。
明军副将麻岩等皆被杀，总兵马林仅自己率数人逃走。
明朝刘綎所率的东路军因山路崎岖，行动困难，未能按期进至赫图阿拉。因不知西路、北路已经失利，仍按原定计划向北开进。
努尔哈赤击败马林军后，立即移兵，迎击刘军。
公元1619年三月初三，为全歼刘军，努尔哈赤采取诱其速进，设伏聚歼的打法，事先以主力在阿布达里岗布置埋伏，另以少数士兵冒充明军，穿着明军衣甲，打着明军旗号，持着杜松令箭，诈称杜松军已迫近赫图阿拉，要刘綎速进。
刘綎信以为真，立即下令轻装急进。
三月初四，明军东路刘铤军从宽奠出发时，后金东边的人民都躲避到深山老林中去了。刘铤率军一路上攻占山寨，将瘸子、瞎子等不能动的人杀死，一路向前进军。刘綎先头部队进至阿布达里岗时，遭到伏击，兵败身死。
努尔哈赤乘胜击败其后续部队。
杨镐坐镇沈阳，掌握着一支机动兵力，对三路明军没有作任何策应。及至杜松、马林两军战败后，才在三月初五，慌忙传令李如柏军回师。
李如柏军行动迟缓，仅至虎拦岗。
当他接到撤退命令时，被后金哨探发现，后金哨探在山上鸣螺发出冲击信号，大声呼噪。
李如柏军以为是后金主力发起进攻，惊恐溃逃，自相践踏，死伤1000余人。
朝鲜军队元帅姜弘立率领剩余的五千兵下山来投降，后金设宴款待他们之后，将他们释放回国，并且修书给朝鲜国主光海君。
萨尔浒之战，以明军的失败、后金军的胜利而告结束。
此战之后，后金军乘势攻占开原、铁岭，征服了叶赫部，酋长金台吉、布扬古被杀死，余部俱降建州。朝鲜王朝的光海君于公元1619年农历五月，派遣使者去后金致谢，从此对后金与明朝采取中立政策。
明军主帅杨镐兵败之后立即引咎辞职，后被拘押，崇祯二年被处决。
杜松与刘綎已死于战场，马林也于三个月后在开原战死，明军四路主将四人已失其三，仅有李如柏始终未遇敌，但在战役之后数日即为言官弹劾。
一年半后辽事更坏，此事再被提及，李如柏自杀以明志。
萨尔浒战役后，后金彻底起势，明朝再也压制不住后金，这也导致了后来满清入关。
至此，后金成了大明的心头之患。