3月1 0日，曰本陆军由近卫师团、第2师团和第12师团组成的第1军，正式进驻朝鲜半岛，在鸭绿江西方大洋河口的大孤山实施登陆，然后直指奉天。而准备以第9、10、11师团组成第2军，在大连湾登陆，进攻旅顺。并计划将司令部设在大同江口的镇南浦。
同日，日本政府向华东政府发出外交函，向华东政府救援了2 9名日本士兵表示感谢，并且通知华东政府，希望将原定于3月份协商双方合作对俄作战推移到4月份，因此现在日本的军令部都在为日俄战争忙碌，实在是抽不出时间来，当然日本也再三的道歉。华东政府到也通情达礼，表示了理解，同意日本推迟协商的时间。
原来日本是希望在第二次闭塞作战之后再举行这次协商，如果第二次闭塞作战取得成功，那么日本将会在协商中取得较大的主动权。另外现在俄国远东舰队海参崴分舰队也开始出击，破坏日本的海上交通线，己击沉了两艘商船，海参崴分舰队的主力是两艘大型装甲巡洋舰：留里克号、格罗姆鲍伊号；大型防护巡洋舰壮士号，而现在联合舰队要全力对付太平洋舰队，分不出兵力在对付海参崴分舰队，因此第二次闭塞作战也成为战争进行关建。
联合舰队经过了认真的准备，这一次动的船只有4艘，为千代丸、副井丸、米山丸、弥彦丸，比第一次还要少1艘， 因为秋山真之和其他参谋们商议之后，认为有了第一次闭塞作战的经验，而且己有一艘船沉在预定的地点，只需要再有二艘船沉在预定地点，也就足够阻塞住航道了，因此第二次闭塞作战的难度应该不大，4艘船就足够了，毕竟只要有50％的成功率就行。而参加闭塞作战军官，有闭塞作战计划的俱体策划者有马良橘、还有上一次唯一个将船沉在预定地点的广濑武夫，联合舰队上下对都这一次作战都充满了信心。
东乡平八郎于3月23日下达了进行第二次闭塞作战的命令，联合舰队于3月26日凌晨2点30分从仁川港出发，再次向旅顺港驶去，于下午6点到达円岛东南25海里处，闭塞船队于27日凌晨1点到达老铁山南方。
不过这一次闭塞作战从一开始就遭遇不利，船队还没接近旅顺外港，就被俄军海岸探照灯发现，岸上炮台开始猛烈炮击。
原来新任的太平洋舰队司令官马卡洛夫己在3月8日到达旅顺上任，虽然马卡洛夫接手的是一个烂摊子，但上任了不到20天，马卡诺夫却展现出了名将的素质，首先迅速罢免了一批无能的军官，将一批年轻有为的军官迅速提拔到关键岗位。又提高了普通士兵和岸上码头工人的待遇，因此伤损军舰的修复速度也明显加快；而在战术上，马卡诺夫加强了太平洋舰队的行动，改变原来的拖船使用办法，使得舰队出港时间从12个小时缩短到3个小时，并且在辽东半岛沿海地区布雷，干涉日本舰队的行动，又经常派遣舰队出海活动，一面侦察敌情，一面也是以攻代守；同时又电令海参崴分舰队出击，袭扰日军海上交通线。
而且马卡洛夫的工作不仅仅局限于海军，还协助海岸炮兵完善了火炮控制系统，在黄金山的山顶设置了信号杆，组织海军和陆军进行协同训练等等。可以说在不到2 0天的时间里，马卡洛夫做完了他的前任在几年时间都没有完成的工作。并且使整个旅顺港内的俄军都涣然一新，军心士兵都有了相当的提升。
这几天日本军舰加强了对旅顺港的侦察，马卡洛夫也意识到日本在近日内很可能又会进行闭塞作战，于是也在旅顺港内作好了充份的迎战准备。先是下令将汽轮海拉尔号、哈尔滨号沉没在港外老虎尾半岛中部的东海岸，阻碍日本船队的行动路线，又安排驱逐舰定期在港外巡逻，并注意隐蔽，如果遭遇敌舰，在有可能的情况下可以实施偷袭，并在外港又布置军舰守卫。
闭塞舰队到达旅顺港附近时，俄舰队由炮舰波布尔号、阿茨瓦吉涅号担任警戒任务，驱逐舰希尔涅号、莱西特里涅号驻守外港，随时待命出动。因此闭塞舰队接近旅顺港时，遭到两岸炮台和港内军舰的联合炮击。
结果前后仅20多分钟，4艘闭塞船就全部被击沉或是被迫自爆沉没，但却没有一艘突进到旅顺外港，更不用说是闭塞航道了。