朱祁镇以和谈为借口，请求也先派喜宁去谈判，而他秘密策划镇守大同的将领抓了喜宁，然后，把他杀了。
另外，朱祁镇又授计给王伟，让他诱杀了奸细小田儿。
这两件事，可见朱祁镇不是等闲之辈，他在被俘的生涯中，逐渐成熟起来。
也先没有了喜宁在从中作梗，开始有放回太上皇的意思，派使者来联系。
这样一来，京师的戒备才稍稍放松了一点。
于谦上言：“南京重地，需要有人加以安抚稳定。中原有很多流民，假如遇上荒年，互相呼应聚集成群，这是很值得担心的。请敕令内外守备和各处巡抚用心整顿，防患于未然，召回派往内地召募发兵的文武官员让他们镇守中宫。”
八月，太上皇朱祁镇被留在北方已经一年。
也先见明朝没有什么事端，更想讲和，使者接连前来，提出把太上皇送回。
大臣王直等商议派使者前往迎接，朱祁钰却不高兴地说：“朕本来不想登大位，当时是被推上来的。”
他的意思很明显，不想自己这个哥哥回来，怕他威胁到自己的皇位。
于谦从容地说：“帝位已经定了，不会再有更改，只是从情理上应该赶快把他接回来罢了。万一他真有什么阴谋，我就有话说了！”
朱祁钰对于谦，可谓是绝对的信任，当下改变了面色，说：“听你的！听你的！”他先后派遣了李实、杨善前往，终于把上皇接了回来。
也先放回了太上皇朱祁镇后，请求朝贡。
他之所以和明朝作对，就是因为贡使增加到三千余人，对给予的赏赐不满足，这才入侵的。
此次朝贡，也先又派三千人来朝。
于谦请求列兵居庸关以备不测，在京师隆重陈兵，设宴招待。
他想朱祁钰说和议是很难依靠，当下逐条进上安定边境的三个策略。他请求敕令大同、宣府、永平、山海、辽东各路总兵官增修墙准备防御。而京兵分别隶属于五军营、神机营、三千营，虽然各设有总兵，但不相统一，请求选择精锐十五万人，分为十营团操。
明朝也至此开始了团营的制度。
至于对瓦剌派来的贡使，于谦一一满足了他们。
于谦主持兵部工作时，也先的势力正在扩张，而福建邓茂七、浙江叶宗留、广东黄萧养各自拥有部众和自封的封号，湖广、贵州、广西、瑶、侗、苗、僚到处蜂起作乱，前后的军队征集调遣，都是于谦独自安排。
每当战事匆忙急迫，瞬息万变的时候，于谦眼睛看着手指数着，随口讲述奏章，全都能按照机宜采取正确的方针方法。
同事和下属接受命令，彼此看着都感到惊骇佩服。
于谦的号令非常严明，勋臣老将稍有不守法度，立即请圣旨切实责备。
于谦的一张小字条送到万里外，将领们，没有不谨慎小心执行的。
于谦的才思畅通敏捷，考虑的事情周到仔细，一时没有人能比得上。
他性情淳朴忠厚过人，忘身忧国。
对于太上皇朱祁镇的回来，于谦一点也不说自己的功劳。
在东宫改易后，也就是换了太子。
太子，原来是朱祁镇的儿子朱见深，朱祁钰把他换成自己的儿子朱见济。
朱祁钰命令，凡是兼东宫太子宫属者支取两份俸禄。
于谦正可领两份俸禄，但他一再推辞，坚决不接受。
他所过的生活很简单俭朴，所居住的房子仅仅能够遮挡风雨。
朱祁钰赐给他西华门的府第，于谦推辞说：“国家多难，臣子怎么敢自己安居。”
他把朱祁钰所赏赐的玺书、袍服、银锭之类，全部封好，写上说明放到那里，每年去看一看而已。
这些品德，使得于谦的名望越来越高。