武则天当上皇帝的第二年，也就是天授二年，公元691年九月，她重用狄仁杰，把他由洛州司马升任地官侍郎，代理尚书事务，并加授同凤阁鸾台平章事，成为宰相。
武则天对他道:“你在汝南为官时有良好的政绩，但却有人在中伤你，你可知道是谁吗?”
狄仁杰答道:“如果陛下认为臣做错了，臣当改过;如果陛下明白臣并无过错，这是臣的幸运。臣不想知道中伤我的人是谁，还会把他视为我的朋友。”
武则天听了，为之叹服。
狄仁杰做了宰相后，勤于职责，为百姓着想，平反不少冤假错案，成为百姓口中的青天，后世把他的破的案子编成了《狄公案》，使得狄仁杰也成了破案专家。
他这样做，使得一个人看他非常不顺眼，因为这个人天生就是公正的仇人，那就是来俊臣！
来俊臣看到狄仁杰这样的做法，那不是要砸自己饭碗吗？
他当下决定要害死狄仁杰！
武则天称帝之前重用酷吏，那是因为要打击反对自己的人；如今当上皇帝了，要重用的，当然是于国有用的大才，所以，她选择了狄仁杰。
由此可见，武则天并不是一个只会残杀别人，不懂治国的人。
来俊臣酝酿已久，终于找到了一个武则天都会要狄仁杰死的罪名来诬陷狄仁杰了！
那就是谋反！
武则天是看重人才，但是，她更看重的是她的地位！谁阻碍了她的地位，别说人才，就是儿子，她也照样要杀！
长寿元年，公元692年正月，来俊臣诬告狄仁杰等大臣谋反，将他们逮捕下狱！
来俊臣把所发明的刑罚拿出来，就要置狄仁杰于死地！
狄仁杰面对来俊臣的刑逼，知道不承认谋反的话，很快被折磨死，所以，他决定承认！
按照当时律法规定，一经审问即承认谋反的人可以减免死罪。
狄仁杰当场认罪说:“大周革命，万物惟新，唐室旧臣，甘从诛戮，反是实!”
来俊臣得到口供，欣喜万分，以为他必死无疑了！当下将狄仁杰等人收监，只待来日行刑，不再严加防备。
判官王德寿见狄仁杰承认谋反，想借机搞死自己的对头杨执柔，当下对狄仁杰说：“尚书的事就算过去，并且能得到减免死罪的判决。我今天也是受人驱使，只是想求得少爬些台阶，想凭借尚书来牵连杨执柔，可以吗？”
狄仁杰听了，说：“要我怎么办？”
王德寿说：“尚书从前在礼部，而杨执柔在礼部任某司的员外，你来牵连他一下还是完全可以的。”
狄仁杰听了，断然拒绝说：“皇天后土啊，竟然让我狄仁杰干这种事！”说完，一头撞在柱子上，鲜血覆盖了他的脸颊。
王德寿见他这样，十分恐惧，因为狄仁杰要是死掉的话，自己不被武则天整死，也要被来俊臣整死，当下忙忙告辞。
狄仁杰宁愿撞死也不愿意牵连杨执柔，这说明了他并不怕死。那么，他为什么要承认谋反呢？因为他很清楚，在来俊臣面前不承认的话，除了死路一条，没有其它路可走！承认的话，兴许还有活的机会！
果然，狄仁杰承认谋反之后，他自由了很多。
他从看守者那里借得笔砚，又扯了一块头巾，在上面书写起来，述说了自己的冤枉和遭受的痛苦，然后藏在绵衣内。