石遵杀了石冲，逼走符洪，以为没人敢跟自己作对了，没想到，还是有人要跟他作对。
这个人就是乐平王石苞。
石苞见石遵弑君杀兄，又当皇帝，心中不服，当下谋划率领关中兵众攻打邺城。
左长史石光、司马曹曜等人竭力劝谏，石苞大怒，杀了石光等一百多人。
石苞生性贪婪又无谋略，未发动政变，就先杀了那么多自己人，有失之士一看就知道他一事无成。
于是，就有人把石苞想攻打邺城的事情禀报东晋梁州刺史司马勋。
司马勋听说了之后，心里想着石苞去攻打邺城，那他肯定没有防备东晋了，正是进攻后赵，给它来个措手不及的好机会，当下便率领兵众讨伐石苞。
司马勋率兵出骆谷，攻克后赵的长城戍，在悬钩设置营垒，离长安二百余里。他派治中刘焕攻打长安，杀了京兆太守刘秀离，又攻克贺城。三辅地区的豪杰之士大多都杀掉郡守县令等官吏，以响应司马勋。此时，司马勋共有三十多座营垒，五万兵众。
石苞本想着攻打邺城的，没想到还没攻打，就被东晋的人马打得半死，当下忙派他的部将麻秋、姚国等统领士兵抵抗司马勋。
石遵自然收到石苞想打自己的消息，所以，派车骑将军王朗率领二万精锐骑兵，以讨伐司马勋为名。
石苞不知道，还以为是来援助自己的，当下对石遵的人马毫无防范。
石遵的人马趁机把石苞劫持了，然后送到邺城。
司马勋这时手下兵力不足，由于害怕王朗的精锐骑兵，不敢继续前进。十月，司马勋放弃悬钩，攻克宛城，杀死后赵南阳太守袁景后回到梁州。
石遵收拾了石苞，以为再也没有什么威胁了，哪里知道，真正的威胁不在外面，而在萧墙之内。
对他致命威胁的人，就是他重用的侄子冉闵。
在李城起兵时，石遵就对冉闵说：“努力吧！事情成功后，让你做太子。”
石遵虽然称为天子，天子无戏言，而在石遵看来，他说过的话，往往都是戏言。
他立太子，当然是自己的亲生儿子石衍了，因为肥水不流外人田。
冉闵大感失望，自认为功高一时，应当成为太子。
自此，冉闵对石遵心生不满，想着灭了石遵。
冉闵英勇善战，屡立战功，四夷和中原将领都害怕他。眼下他做了都督，总揽内外兵权，又让手下的将士，出任殿中员外将军，封爵关外侯。
石遵对于冉闵的所做所为不加怀疑，而一些大臣已经看出了危害。
中书令孟准、左卫将军王鸾劝石遵应该逐渐剥夺冉闵的兵权，孟准等人则都劝说石遵把冉闵杀掉。
石遵也渐渐感觉到冉闵的威胁，当下把石鉴和乐平王石苞、汝阴王石琨、淮南王石昭等人召入宫，来到郑太后面前进行商议。
石遵看着众藩王说：“冉闵不忠于君主的迹象已逐渐明显，如今我想把他杀掉，大家觉得怎么样？”
石鉴等人乐得看他们自相残杀，当下都说：“应当如此！”
郑太后反对说：“当初在李城起兵时，如果没有冉闵，岂能有今天？冉闵有点居功自傲，应当对他有所宽纵，怎么能急急忙忙把他杀掉呢？”
石遵听见太后反对，又犹豫了起来，没有立即去执行。